Python
20210926_机器学习预测转录因子结合位点
2023年3月25日 02:03
机器学习预测转录因子结合位点的原理是通过建立一个数学模型来学习已知的转录因子结合位点和非结合位点之间的特征关系，并使用这个模型来预测新的转录因子结合位点。
Song Wei
生物信息学
20211107_鉴定并去除Illumina测序中的PCR重复序列
2023年3月24日 01:57
在Illumina测序过程中，由于PCR扩增时会复制出原始DNA片段的多个拷贝，它们可能会被误认为是不同的DNA分子，从而导致PCR扩增偏好性和测序错误等问题。
Song Wei
生物信息学
20221028_GetOrganelle组装细胞器基因组
2023年3月24日 00:04
Getorganelle可以自动从混合基因组测序数据中提取和装配线粒体和叶绿体DNA，同时也支持使用外部线粒体和叶绿体序列库进行装配。
Song Wei
生物信息学
20210110_NCBI批量下载fasta文件方法
2023年3月22日 15:24
Entrez Direct是一种命令行界面的工具，它是NCBI（美国国家生物技术信息中心）提供的一种工具，可用于直接从NCBI数据库检索和下载生物信息学数据。
Song Wei
Python
20220102_python多进程multiprocessing使用方法
2023年3月16日 06:11
Python multiprocessing 是 Python 标准库中提供的一个多进程处理模块，它允许在 Python 中方便地使用多进程并行处理数据和任务，从而加快程序的运行速度。
Song Wei
生物信息学
20201106_BUSCO评估基因组组装完整度方法
2023年3月12日 05:43
BUSCO是一种用于评估基因组组装和注释质量的工具，其基本原理是通过检测核心基因组的一组单拷贝基因来评估组装的完整性和准确性。
Song Wei
生物信息学
20210318_WGCNA_加权基因共表达网络分析
2023年3月12日 05:43
WGCNA分析可以识别共表达的基因集，这些基因集具有高度相关性，通常与生物学过程、细胞类型和疾病状态相关联。
Song Wei
生物信息学
20220324_比较基因组结果可视化
2023年3月12日 05:43
pafr软件可以用来查看基因组与参考基因组的比对结果，包括比对的长读序列和参考基因组序列、比对的位置、匹配度、误差率等信息。
Song Wei
心情随笔
生物信息学
20210807_Motif富集分析方法
2023年3月12日 05:43
motif是指在生物序列中具有重复出现、高度保守的短序列模式，如转录因子结合位点、RNA结构域等。
Song Wei
最新文章
推荐阅读
网站浏览
