生物信息学
20210110_NCBI批量下载fasta文件方法
2023年3月22日 15:24
Entrez Direct是一种命令行界面的工具,它是NCBI(美国国家生物技术信息中心)提供的一种工具,可用于直接从NCBI数据库检索和下载生物信息学数据。
Song Wei
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生物信息学
20201106_BUSCO评估基因组组装完整度方法
2023年3月12日 05:43
BUSCO是一种用于评估基因组组装和注释质量的工具,其基本原理是通过检测核心基因组的一组单拷贝基因来评估组装的完整性和准确性。
Song Wei
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生物信息学
20210318_WGCNA_加权基因共表达网络分析
2023年3月12日 05:43
WGCNA分析可以识别共表达的基因集,这些基因集具有高度相关性,通常与生物学过程、细胞类型和疾病状态相关联。
Song Wei
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生物信息学
20220324_比较基因组结果可视化
2023年3月12日 05:43
pafr软件可以用来查看基因组与参考基因组的比对结果,包括比对的长读序列和参考基因组序列、比对的位置、匹配度、误差率等信息。
Song Wei
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生物信息学
20210807_Motif富集分析方法
2023年3月12日 05:43
motif是指在生物序列中具有重复出现、高度保守的短序列模式,如转录因子结合位点、RNA结构域等。
Song Wei
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生物信息学
20220519_生物信息平台搭建及生物信息软件安装
2023年3月12日 05:43
在Linux系统上搭建生物信息平台并安装常用生物信息软件,包括基础软件安装和常用生物信息软件安装两个部分。
Song Wei
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生物信息学
20220519_提取基因5'UTR与3'UTR与启动子序列的方法
2023年3月12日 05:43
5'UTR、3'UTR和启动子序列是非编码序列,不会被转录为蛋白质,但它们在基因的表达中起着非常重要的作用。
Song Wei
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生物信息学
20220518_基因组contig与scaffold的N50大小统计
2023年3月12日 05:43
统计Contig和Scaffold的N50值是衡量基因组拼装质量的常用方法之一,它能够反映基因组拼装的连续性和完整性。
Song Wei
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